选项A，需要同时达到不缴或者少缴应纳税款100万元以上，且任一年度不缴或者少缴应纳税款占当年各税种应纳税总额10%以上的，才会被确认为重大税收违法失信主体；选项E，虚开增值税普通发票100份以上或者金额400万元以上的纳税人，会被确认为重大税收违法失信主体。
【考点】重大税收违法失信主体是指有下列情形之一的纳税人、扣缴义务人或者其他涉税当事人：
（1）伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿、记账凭证，或者在账簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款100万元以上，且任一年度不缴或者少缴应纳税款占当年各税种应纳税总额10%以上的，或者采取前述手段，不缴或者少缴已扣、已收税款，数额在100万元以上的；
（2）欠缴应纳税款，采取转移或者隐匿财产的手段，妨碍税务机关追缴欠缴的税款，欠缴税款金额100万元以上的；
（3）骗取国家出口退税款的；
（4）以暴力、威胁方法拒不缴纳税款的；
（5）虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的；
（6）虚开增值税普通发票100份以上或者金额400万元以上的；
（7）私自印制、伪造、变造发票，非法制造发票防伪专用品，伪造发票监制章的；
（8）具有偷税、逃避追缴欠税、骗取出口退税、抗税、虚开发票等行为，在稽查案件执行完毕前，不履行税收义务并脱离税务机关监管，经税务机关检查确认走逃（失联）的；
（9）为纳税人、扣缴义务人非法提供银行账户、发票、证明或者其他方便，导致未缴、少缴税款100万元以上或者骗取国家出口退税款的；
（10）税务代理人违反税收法律、行政法规造成纳税人未缴或者少缴税款100万元以上的；
（11）其他性质恶劣、情节严重、社会危害性较大的税收违法行为。