肝癌的组织学分为3个类型，肝细胞癌最多见，是由肝细胞发生的肝癌。其分化较好者癌细胞与正常的肝细胞相似。分化差者癌细胞异型性明显，常有巨核及多核瘤细胞。胆管上皮癌较为少见，是由肝内胆管上皮发生的癌。其组织结构多为腺癌或单纯癌。混合性肝癌具有肝细胞瘟及胆管上皮癌两者结构，最少见。