疾病发生的原理虽然错综复杂，但从总体而论，不外乎致病因素作用于人体引起机体的损伤和机体动员各种防卫代偿功能对抗损伤的矛盾斗争过程。损伤和抗损伤作为疾病发生发展的一对基本矛盾，贯穿于疾病始终并决定疾病的发展方向和结局。发病的基本原理为正气不足是发病的内在原因、邪气是发病的重要条件、正邪斗争的胜负决定是否发病。