建立健康档案的基本原则应体现以下三点：①自愿为主，多种方式相结合在居民自愿的基础上，采取多种方式建立健康档案，不要求采用统一的方式建立健康档案。②体现健康管理和连续性服务的特点健康档案是在传统意义基础上扩大的病历记录，含居民基本信息、临床与保健记录等内容。通过健康档案的有效管理，能够体现健康管理和连续性服务的特点。③科学性与灵活性相结合。档案管理首先不能远离医务人员，以免由于利用不便，成为实际意义的“死档”。同时要保持健康档案的科学性，对上门接受服务的人群一家庭一套；由于目前的人力、物力、财力的条件限制，不要求为所有辖区居民建立健康档案，可分批、有重点地针对重点人群先行建立档案并进行动态管理，也可对参加新型农村合作医疗的人群先行建立健康档案。