(1)A(2)B(3)BC

1.青年男性，腹痛便血，合并肛瘘，首先考虑克罗恩病，首选结肠镜检查并多点取病理活检，结肠镜应进入回肠末段进行观察，如果活检病理提示非干酪样肉芽肿即可确诊。故首选结肠镜。BCDE检查也是可选，但不是最直观的。
2.肛瘘是炎症性肠病中克罗恩病的一个典型并发症，而溃疡性结肠炎发生肛周病变的几率低，结肠癌虽然有年轻化趋势，但是不是首先考虑的，C和D也是常见的腹痛便血的原因，需要排除。基于为最可能，首先B。
3.A为感染性肠炎可选，D为抗结核药，E为结肠癌的化疗药物，B和C为氨基水杨酸制剂，可选。